MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	TAT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
2	NC_012169	T	6	6	971	976	0 %	100 %	0 %	0 %	224796535
3	NC_012169	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
4	NC_012169	CAA	2	6	995	1000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796535
5	NC_012169	ATATAA	2	12	1002	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
6	NC_012169	TTA	2	6	1017	1022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
7	NC_012169	AT	3	6	1032	1037	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
8	NC_012169	TA	3	6	1042	1047	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
9	NC_012169	A	7	7	1068	1074	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
10	NC_012169	AT	3	6	1082	1087	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
11	NC_012169	TAAAA	2	10	1099	1108	80 %	20 %	0 %	0 %	224796535
12	NC_012169	TAAAA	2	10	1126	1135	80 %	20 %	0 %	0 %	224796535
13	NC_012169	CTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796535
14	NC_012169	AT	3	6	1162	1167	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
15	NC_012169	TA	3	6	1189	1194	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
16	NC_012169	A	7	7	1226	1232	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
17	NC_012169	CAAA	2	8	1254	1261	75 %	0 %	0 %	25 %	224796535
18	NC_012169	A	6	6	1263	1268	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
19	NC_012169	ATT	2	6	1297	1302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796535
20	NC_012169	A	6	6	1343	1348	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
21	NC_012169	A	9	9	1385	1393	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
22	NC_012169	TAA	2	6	1408	1413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
23	NC_012169	TCA	2	6	1445	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796535
24	NC_012169	TAA	3	9	1455	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
25	NC_012169	AT	3	6	1474	1479	50 %	50 %	0 %	0 %	224796535
26	NC_012169	TATT	2	8	1485	1492	25 %	75 %	0 %	0 %	224796535
27	NC_012169	AATA	2	8	1502	1509	75 %	25 %	0 %	0 %	224796535
28	NC_012169	T	8	8	1530	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	224796535
29	NC_012169	AAAT	2	8	1561	1568	75 %	25 %	0 %	0 %	224796535
30	NC_012169	CTAA	2	8	1574	1581	50 %	25 %	0 %	25 %	224796535
31	NC_012169	AAAC	2	8	1594	1601	75 %	0 %	0 %	25 %	224796535
32	NC_012169	A	6	6	1608	1613	100 %	0 %	0 %	0 %	224796535
33	NC_012169	AAATTA	2	12	1617	1628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796535
34	NC_012169	A	6	6	1654	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
35	NC_012169	ACA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796533
36	NC_012169	TAAAAA	2	12	1721	1732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224796533
37	NC_012169	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
38	NC_012169	TAA	2	6	1824	1829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796533
39	NC_012169	AAC	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796533
40	NC_012169	A	9	9	1864	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
41	NC_012169	TTC	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796533
42	NC_012169	AAATA	2	10	1928	1937	80 %	20 %	0 %	0 %	224796533
43	NC_012169	A	6	6	1965	1970	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
44	NC_012169	T	6	6	1980	1985	0 %	100 %	0 %	0 %	224796533
45	NC_012169	A	6	6	1990	1995	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
46	NC_012169	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796533
47	NC_012169	ATT	2	6	2041	2046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796533
48	NC_012169	AGG	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796533
49	NC_012169	A	6	6	2112	2117	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
50	NC_012169	ATAA	2	8	2143	2150	75 %	25 %	0 %	0 %	224796533
51	NC_012169	A	7	7	2170	2176	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
52	NC_012169	A	6	6	2215	2220	100 %	0 %	0 %	0 %	224796533
53	NC_012169	CTTT	2	8	2262	2269	0 %	75 %	0 %	25 %	224796545
54	NC_012169	TCA	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
55	NC_012169	AGG	2	6	2371	2376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224796545
56	NC_012169	TTAC	2	8	2402	2409	25 %	50 %	0 %	25 %	224796545
57	NC_012169	ATTCA	2	10	2434	2443	40 %	40 %	0 %	20 %	224796545
58	NC_012169	AGA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
59	NC_012169	ATA	2	6	2495	2500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
60	NC_012169	CAA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796545
61	NC_012169	TTCA	2	8	2530	2537	25 %	50 %	0 %	25 %	224796545
62	NC_012169	AAT	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
63	NC_012169	A	6	6	2552	2557	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
64	NC_012169	ATC	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
65	NC_012169	TC	3	6	2610	2615	0 %	50 %	0 %	50 %	224796545
66	NC_012169	A	7	7	2623	2629	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
67	NC_012169	CAG	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796545
68	NC_012169	CTT	2	6	2664	2669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796545
69	NC_012169	TTA	2	6	2696	2701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
70	NC_012169	CCT	2	6	2705	2710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796545
71	NC_012169	T	6	6	2740	2745	0 %	100 %	0 %	0 %	224796545
72	NC_012169	TGC	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796545
73	NC_012169	AAT	2	6	2796	2801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
74	NC_012169	TTA	2	6	2864	2869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
75	NC_012169	TAT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796545
76	NC_012169	CTG	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224796545
77	NC_012169	T	6	6	3063	3068	0 %	100 %	0 %	0 %	224796545
78	NC_012169	GAAT	2	8	3074	3081	50 %	25 %	25 %	0 %	224796545
79	NC_012169	TCA	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796545
80	NC_012169	AAGG	2	8	3135	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	224796545
81	NC_012169	A	6	6	3165	3170	100 %	0 %	0 %	0 %	224796545
82	NC_012169	AGA	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
83	NC_012169	AGA	2	6	3229	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
84	NC_012169	TCT	2	6	3245	3250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224796545
85	NC_012169	TC	3	6	3283	3288	0 %	50 %	0 %	50 %	224796545
86	NC_012169	CCT	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796545
87	NC_012169	AGA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796545
88	NC_012169	ATA	2	6	3420	3425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
89	NC_012169	ATA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796545
90	NC_012169	AATTAG	2	12	3560	3571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224796543
91	NC_012169	GAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796543
92	NC_012169	A	7	7	3690	3696	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
93	NC_012169	A	6	6	3747	3752	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
94	NC_012169	ATA	2	6	3789	3794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
95	NC_012169	A	6	6	3805	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
96	NC_012169	GAA	2	6	3817	3822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796543
97	NC_012169	TTA	2	6	3859	3864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
98	NC_012169	A	8	8	3987	3994	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
99	NC_012169	TTA	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
100	NC_012169	CAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796543
101	NC_012169	ATA	2	6	4066	4071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
102	NC_012169	ATTT	2	8	4139	4146	25 %	75 %	0 %	0 %	224796543
103	NC_012169	A	7	7	4147	4153	100 %	0 %	0 %	0 %	224796543
104	NC_012169	AGT	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796543
105	NC_012169	ACT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
106	NC_012169	ATC	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
107	NC_012169	AAC	2	6	4287	4292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224796543
108	NC_012169	ATAA	2	8	4313	4320	75 %	25 %	0 %	0 %	224796543
109	NC_012169	TAT	2	6	4331	4336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
110	NC_012169	AATT	3	12	4370	4381	50 %	50 %	0 %	0 %	224796543
111	NC_012169	T	6	6	4408	4413	0 %	100 %	0 %	0 %	224796543
112	NC_012169	TCA	2	6	4435	4440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796543
113	NC_012169	ATA	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796543
114	NC_012169	ATT	2	6	4596	4601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796543
115	NC_012169	ATTA	2	8	4603	4610	50 %	50 %	0 %	0 %	224796543
116	NC_012169	AGC	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
117	NC_012169	TGA	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224796542
118	NC_012169	AAT	2	6	4817	4822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
119	NC_012169	A	6	6	4842	4847	100 %	0 %	0 %	0 %	224796542
120	NC_012169	AGA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796542
121	NC_012169	A	6	6	4878	4883	100 %	0 %	0 %	0 %	224796542
122	NC_012169	AGTA	2	8	4890	4897	50 %	25 %	25 %	0 %	224796542
123	NC_012169	ATT	2	6	4941	4946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
124	NC_012169	ATAA	2	8	4958	4965	75 %	25 %	0 %	0 %	224796542
125	NC_012169	ATT	2	6	4989	4994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224796542
126	NC_012169	AAAT	2	8	5002	5009	75 %	25 %	0 %	0 %	224796542
127	NC_012169	TCC	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224796542
128	NC_012169	CAG	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
129	NC_012169	ATA	2	6	5112	5117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
130	NC_012169	AAG	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224796542
131	NC_012169	CCA	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224796542
132	NC_012169	CTTT	2	8	5175	5182	0 %	75 %	0 %	25 %	224796542
133	NC_012169	A	7	7	5230	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	224796542
134	NC_012169	CAT	5	15	5240	5254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224796542
135	NC_012169	AT	3	6	5279	5284	50 %	50 %	0 %	0 %	224796542
136	NC_012169	AGC	2	6	5292	5297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224796542
137	NC_012169	TAAAA	2	10	5330	5339	80 %	20 %	0 %	0 %	224796542
138	NC_012169	T	6	6	5340	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	224796542
139	NC_012169	TAA	2	6	5361	5366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224796542
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